义和团运动以八国联军入侵中国并强迫清政府签订不平等的《辛丑条约》(1901年)而告终。在签订《辛丑条约》的过程中,根据美国的提议,西方列强达成协议,这次不提出割地要求,保留中国主权完整,但要中国实行门户开放政策,使各国“利益均沾”,在中国的权利得到保障。清政府以保住其统治地位而答应了侵略者的要求。《辛丑条约》虽然没有割让土地的条款,中国在形式上仍然是个独立的、统一的国家,但实际上通过这个条约,列强在中国取得了驻军权、政治控制权、经济掠夺权,使中国不过是个在列强共管下的半殖民地国家。
辛丑条约中列强除了要求清政府巨额赔款及出让经济、外交等特权外,为了防止再发生类似于义和团运动的人民反抗, 兴还特别规定“永远禁止中国人民成立或者加入具有反帝性质的组织,违者一律处死。对一切反帝活动,地方官员应负有责任,不力者予以革职。”这一条款的订立为基督教传教事业扫除了障碍,既有强大的政治经济权作后盾,又有从中央到地方各级政府的保护,传教士可以毫无阻挡地进入内地传教,不必担心会遭到抵抗和反对。

1992年12月24日圣诞夜,
北京基督教会崇文门堂举行了烛光圣乐崇拜会。
这是唱诗班在诵唱进堂歌
庚子事变使中国蒙受了巨大损失,也使中国人民认识到,当中国的传统文明遭到西方文明的冲击时,盲目自大,泥故拒变终要挨打;以落后的方式如迷信、拳术、符咒及盲目排外的行动更不能取胜。惟一的出路是谋求变革,中国的先进分子开始关注中国社会的弊病,寻找社会改革的良方。20世纪以后,尽管社会上反教的情绪并未平息,但做法上已与以前有很大不同,人们不是简单地排斥外来文化,而是从西方文化中吸取先进的科学的成分,以谋求自身的强大。义和团运动失败后,清政府中的顽固派被“惩办”,顽固守旧势力遭到沉重打击,一部分推行新政的“新洋务派”掌握了一些地方实权,他们力图仿效西方近代化过程,通过新政、立宪运动等变革来为中国寻找新的出路。虽然经历了变法失败,六君子被杀,但革命并未停止。以孙中山为首的资产阶级民主主义者继续通过革命来改变中国社会。美国传教士乐灵生(F.Rawlinson)在《中华归主》中总结1900年以后20年来中国出现极其明显的革命趋势时指出:“这种革命趋势不只是改革中国的旧思想或换掉几个当权人物,而是在此时期内将一切旧原则、旧制度一一革除,而代之以某种新原则、新制度。”

在1987年12月15日晚举行的圣诞音乐会上,
北京基督教青年会口琴队的白燕生、
白荣生、白文生三兄弟一曲口琴合奏,
结束了为期5天的宗教艺术活动。由北京基督教青年会组织的
这次活动,包括文学讲座、音乐欣赏等内容
在20世纪初期的变革中,发生于1911年的辛亥革命,是中国社会的一场深刻变革。辛亥革命推翻了腐败的封建帝制,建立了民主共和国。它不是简单的政权交替,而是将旧制度彻底埋葬。1912年1月1日,中华民国临时大总统孙中山在南京宣誓就职,随即发布《临时大总统宣言书》和《告全国同胞书》,决心“尽扫专制之流毒,确定共和,以达革命宗旨”。3月11日公布的《中华民国临时约法》中明确规定“中华民国人民一律平等,无种族、阶级、宗教之区别”,人民享有“人身、居住、财产、言论、出版、集会、结社、宗教等自由”,在民主共和政体中,基督教的合法地位受到法律保障。政府在处理国家与宗教的关系上,奉行欧美国家倡导的“政教分离”模式:各宗教一律平等,宗教不干预政治,国家保护信仰自由。政教关系的改善为基督教传教事业创造了良好的社会环境,虽然后来袁世凯篡权后曾企图立孔教为国教,但在全国人民和各宗教团体的反对下终被否定,袁世凯本人也因逆历史潮流而倒台。辛亥革命以后,政教分离和信仰自由已被大多数人所接受,成为现代社会的一个标志。