宁玛派
11—12世纪时,西藏僧人中有合称为“三索尔”的索尔波且·释迪生(1002—1062年),索尔迥·喜饶扎巴(1014—1134年),索尔迥·卓浦巴(1074—1134年),与绒·却吉桑波(生卒不详)尊崇8世纪入藏传教的印度僧人莲花生为祖师,依其入藏所传密咒和修行方法,形成派别。这一派别的僧人头戴红帽,俗称 “红教”。该派不重戒律,专持密咒,以“大圆满法”为根本教法。认为一个人的心体本质是纯净和远离尘垢的,在修习中应让人体随意而往,听其自然,并使其能在空虚明净中安住一境,如此便可达到解脱成佛。其根本密典为“十八部怛特罗”,但通常奉行的只有八部。前五部称为“五部出世法”,后三部称为”世间法”。所传秘法有无垢友弘传的幻变密藏和心部等密法;莲花生弘传的金刚撅法、马头明王法、诸神护法;静藏弘传的文殊法;迦罗弘传的真实类法;默那罗乞多弘传的集经等无上瑜伽部密法为该派特有密法。其经典传承分为三系,即索尔波且是第一个把宁玛典籍编辑成系统的人,他把所学全部密法传授给索尔迥·喜饶扎巴。13世纪时这一系曾与元朝联系,到14—15世纪衰微。另一系为与索尔波且同时的绒·却吉桑波所传,主张大圆满法;第三系是以部分伏藏传承为主,以父子承袭或转世形式相传。宁玛派至16—17世纪才有较像样的寺院。后在达赖五世阿旺罗桑嘉措支持下得到较大发展。著名寺庙有多吉扎寺、敏珠林寺、四川西部的竹箐寺和噶妥寺等。

宁玛派主寺之一敏珠林寺
敏珠林寺位于西藏山南地区扎襄县境内。该寺是宁玛派在西藏地区的主寺之一。约11世纪末有一座名塔巴林的寺院,后毁废。吾坚德达林巴(五世达赖的经师)根据五世达赖的旨意于公元1676年在塔巴林寺的废虚上重建寺院,公元1700年竣工,即今敏珠林寺。敏珠林寺传授佛法的区域以南藏为主。过去各地宁玛派大小寺院的僧人和地方政府的官员均来此寺研习藏族文化。

四川甘孜藏族自治州康定县南无寺
南无寺,位于四川甘孜藏族自治州康定县南郊,该寺15世纪后由宁玛派改为噶玛噶举派。17世纪后,寺庙因战乱被毁,其后由降秋伦珠喇嘛等人重新修建了娜姆寺(即现在的南无寺),康熙十六年(1677年),按五世达赖的旨意,原噶玛噶举教派改为格鲁教派。南无寺匾额是清乾隆皇帝亲笔所写,南无与娜姆同义。在历史上,南无寺的喇嘛中有三位高僧曾先后担任过地位崇高的甘丹寺赤巴。1993年南无寺被甘孜藏族自治州列为重点文物保护单位。
白玉寺,位于四川甘孜藏族自治州白玉县城附近.建于17世纪,由宁玛派高僧仁真衮绒喜绕创建。是宁玛派著名的六大寺庙之一。白玉寺中藏有非常丰富的珍贵文物,其中以莲花生大师塑像最为著名。
噶当派
噶当派是仲敦巴·杰维迥乃(1005—1064年)所创立。西藏后弘期佛教的早期学法僧人中,重密法者轻视显教,重师承者则轻视经论,重戒律者又反对密法,致使显密分歧。阿里王子绛曲微迎请印度僧人阿底峡入藏弘法,仲敦巴拜阿底峡为师,学到显密各种教法。阿底峡去世后,弟子们多跟随仲敦巴修行。公元1056年仲敦巴建热振寺为根本道场,后形成噶当派。噶当派所依的主要经典为阿底峡所著七部论,称噶当七论,即《菩提道灯论》、《大乘经庄严论》、《菩萨行》、《集菩萨学论》、《入菩提行论》、《本生曼论》、《集句经论》。噶当派提出修行“三士道”,即下士道、中士道、上士道。下士道不求解脱轮回痛苦,只图获得今生与来世的快乐;中士道只求个人超脱轮回得涅槃的大快乐,而无普渡众生之心;上士道则发普渡众生之菩提心,为利有情而愿成佛。强调僧人要守戒律,显密并重,先显后密。15世纪初,宗喀巴依其主要教义创格鲁派,噶当派遂并入格鲁派。
萨迦派
萨迦派为贡却杰布(1034—1102年)所创立,其子贡呷宁保(1092—1158年)时期才开始发展壮大。“萨迦”,藏语意为“白土”。宋熙宁六年(1073年),贡却杰布在后藏萨迦弘法,在白色土地上建寺,后以此寺为主寺,得名萨迦寺,形成萨迦派。又以此派寺庙围墙涂有象征文殊、观音和金刚手菩萨的红、白、黑三色花条,俗称“花教”,教主由贡却杰布家族世代相承。由血统、法脉两支传承。萨迦派认为世间一切明净空无,应舍弃一切牵挂与执著,断除一切恶行,专心行善积德。主张破除一般人认为万物实有的常见和认为连佛法、涅槃等一切皆无的断见。如此便可达到成佛的目的。该派不禁娶妻,惟规定生子后不再接近女人。在元代(1206—1368年)势力最盛时,第五祖八思巴被元世祖忽必烈封为帝师,并封予西藏13万户领主地位,掌西藏政教大权,成为西藏地方僧侣与贵族统治合而为一之始。元末,其地位被噶举派取代,萨迦派仅保有萨迦地方的政教权力。

萨迦派主寺萨迦寺
萨迦寺位于西藏日喀则地区萨迦县。萨迦寺是藏传佛教萨迦派的主寺。该寺分南北两寺,北寺由萨迦派创始人昆·贡却杰布建于公元1073年。南寺为萨迦派第五代祖师八思巴所建。12世纪萨迦寺已成为西藏的政治、文化中心。萨迦寺藏有极为丰富的佛教经籍,此外还藏有天文、历算、医学、历史、人物传记、哲学、音乐、文法、修辞等各个方面的书籍。由于该寺收藏有难以估量价值的历史文物,被国内外学术界称为除敦煌外中国第二个佛教文化宝库。
塔公寺,位于四川甘孜藏族自治州康定县境内,由萨迦派喇嘛巴登多吉在18世纪所创建,塔公寺属甘孜地区藏传佛教萨迦教派中建寺较早的牧区寺庙。塔公寺中有较多历史文物。其最著名的塔公觉吾殿,供奉的是文成公主离开汉地时带去西藏的众多释迦牟尼像中之一尊,并称为塔公觉吾(觉吾是藏语对释迦牟尼的尊称语)。该寺于1993年被甘孜藏族自治州列为重点文物保护单位。

塔公寺大殿