2000年以来，随着植树造林、围栏封育、塔河生态治理等工程的实施，新疆累计完成平原人工造林93.33万公顷，完成平原天然林封育28.67万公顷，引洪灌溉28.67万公顷，防治土地荒漠化综合治理44万公顷，共完成公路，铁路绿化900多公里。2005年，新疆有植被覆盖区域面积109.34万平方公里，占全区国土总面积的65.96%，比2000年提高了15.8个百分点。森林覆盖率由2000年的1.92%提高到2.94%，绿洲森林覆盖率已达到14.95%。全区城市受沙尘天气影响共计38次，高发期为3～6月。“十五”期间，全区沙尘天气发生频次、影响范围和程序处于稳定状态。

　　截至2005年底，国家计划下达塔里木河流域近期综合治理建设项目200项，累计下达投资50.45亿元，开工建设项目181项，完工项目131项，累计完成投资42.03亿元，累计完成防渗渠道2040公里，高新节水面积2.2万公顷。目前，治理项目基本完成，源流节水成果显著，干流输水量明显增加，下游生态环境得到初步改善。其中博斯腾湖东泵站、恰拉水库改扩建、库玛拉克河东岸总干渠三大标志性工程已基本完工。塔里木河下游河道近30年的断流历史宣告结束，河道两侧的天然植被形成的“绿色走廊”正在恢复，胡杨林恢复面积达1.8万公顷，干流两侧沙化面积减少了3.33万公顷。与此同时，新疆还在重点风沙区塔克拉玛干沙漠南缘开展了红柳大芸种植项目，不仅使当地生态环境有较大改善，而且对周围的绿洲生态系统起到了保护和改善作用。