科研机构配置趋于合理。截至2005年，新疆共有各类科技机构242个，其中是以上政府部门属独立研究开发机构108个，企业技术开放机构80个，高等学校属研究与发展机构19个。从事科技活动人员1.23万人，平均每个机构有科技活动人员51人。

　　科技基础设施和基地建设取得进展。目前，新疆有国家和自治区级重点实验室11个、工程技术研究中心11个、生产力促进中心14个、高新技术产业开发区及工业（农业）园区9个。这些机构在技术创新体系中发挥了积极作用，并促进企业通过产学研结合逐步成为技术创新的主体。

　　科技队伍不断壮大。2005年，新疆地方国有企事业单位专业技术人员已发展到46万人，比2000年增加1.7万人。其中，工程技术人员占12.9%，农业技术人员占8.1%，卫生技术人员占16.9%，科学研究人员占0.6%，教学人员占61.5%。

　　科技队伍的结构趋于优化。2005年，新疆从事科技活动人员2.8万人，其中科学家和工程师1.8万人，占从事科技活动人员的66.5%，比2000年提高了2.8个百分点；大中型工业企业科技活动从中央到地方10096人，其中科学家和工程师占70.5%，提高4.7个百分点。