随着政策性限制、体制性障碍进一步消除，新疆非公有制经济的发展步伐进一步加快。2005年，在工业总产值中，纯国有工业的比重由“十五”初期的24.4%下降到2005年的10.0%；集体所有制工业比重由2000年的6.9%下降为2005年的0.7%。

　　非公有制经济在公路交通运输、建筑、批发零售贸易、餐饮、社会服务等竞争程度较高的行业迅速发展壮大，所占比重大幅度上升。在社会消费品零售总额中，非公有制经济所占比重由2000年的67%上升到2005年的85%左右；多种经济成分的共同发展，活跃了市场，繁荣了经济。

　　2005年末，新疆有个体工商户47.71万户，注册资金92.32亿元，从业人员75.89万人；私营企业达5.17万户，占全区登记注册各类企业总数的60%，首次超过国有和集体企业户数。其中，私营企业集团113家，注册资金100万元到1亿元的私营企业达到1210家，1亿元以上的私营企业达到64家。私营企业注册资金795.39亿元，从业人员67.09万人。个体私营经济组织在新疆经济建设中发挥的作用也越来越大，非公有制经济已经成为新疆国民经济的重要组成部分。

　　目前，新疆已涌现出一批实力雄厚的民营企业集团，全区近一半的国有工业企业被兼并重组于民营企业集团麾下。广汇、康普、宏大、百商、华凌等一批民营企业集团呈现出强劲的发展势头，成为新疆经济增长不可或缺的骨干力量。民营企业集团已由2000年的31家增加到2005年的48家，拥有资产560.97亿元。“十五”期间，民营企业集团共创造经营收入1443.94亿元，实现利润65.38亿元。